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当你将阿里云服务器的操作系统从Linux（假设为非CentOS的Linux发行版）更换为CentOS时，原有操作系统上的所有数据、配置和安装的软件都会被清除。这意味着，更换操作系统相当于重新安装一个新的操作系统环境，原有的所有设置和软件都将不再存在。
具体来说，更换操作系统是一个全新的安装过程，而不是简单的升级或迁移。在这个过程中，服务器会格式化硬盘，安装新的操作系统（即CentOS），并根据你选择的安装选项进行相应的设置。因此，所有之前在旧操作系统上安装的应用程序、服务以及用户自定义的配置文件等都将被删除。
为了避免数据丢失，建议在更换操作系统前做好以下几点准备：
- 备份重要数据：确保对所有重要的文件、数据库以及其他关键数据进行完整备份。可以使用阿里云的对象存储服务OSS来保存这些备份文件。
- 记录当前配置：详细记录当前系统的配置信息，包括但不限于网络配置、防火墙规则、已安装的软件及其版本、服务启动项等。这有助于在新系统中快速恢复相同的配置。
- 规划迁移方案：如果某些应用程序或服务依赖于特定的库或环境，需要提前了解这些依赖在CentOS中的安装方法，并制定详细的迁移计划。
- 测试新环境：在正式更换操作系统之前，可以在一个测试环境中先行安装CentOS，并尝试部署关键应用和服务，确保一切正常运行后再进行正式操作。
此外，阿里云提供了丰富的文档和技术支持，帮助用户顺利完成操作系统的更换和后续的配置工作。如果你在更换操作系统的过程中遇到任何问题，可以随时联系阿里云的技术支持团队获取帮助。
总之，更换操作系统是一个涉及数据清理和重装的过程，因此必须谨慎对待，确保所有必要的准备工作都已完成，以减少不必要的麻烦和损失。